Любая генерация рендерится либо на сплошном фоне, либо на прозрачном. Прозрачный вариант даёт альфа-канал, так что анимация ложится поверх того, что уже есть на таймлайне. Выбирается это чипом фона в композере, до генерации.
Чип фона показывает BG, когда фон сплошной, и No BG, когда прозрачный. При выборе прозрачного в строку-итог под композером добавляется · Alpha.
Выбирайте Transparent, когда анимация идёт поверх другого футажа: титр над говорящей головой, логотип в углу, анимированная выноска, указывающая на что-то в кадре. Альфа-канал означает, что никакого прямоугольника фона, перекрывающего видео, не будет.
Выбирайте With background, когда клип это весь кадр целиком (интро, полноэкранная анимация данных, самостоятельная плашка) и под ним нет ничего, что должно просвечивать.
Обычно прозрачность решается в момент генерации: формат выхода задаёт чип фона в композере. Но один способ передумать позже, не оплачивая новую генерацию, всё же есть. Разблокируйте контролы кастомизации на экране результата: если у клипа есть фон, среди контролов будет тумблер Show background. Выключите его и отрендерите заново, и клип выйдет прозрачным MOV. Если у генерации такого тумблера нет, остаётся сгенерировать заново с вариантом Transparent.
Прозрачный MOV весит больше, чем MP4, потому что ProRes 4444 хранит 10-битный цвет плюс альфа-канал. Так и должно быть. Именно этот формат позволяет Premiere чисто наложить клип поверх вашего футажа.